La Commission Mobilité - Région Neuchâtel Littoral, qui joue également le rôle de Conférence régionale des transports (CRT) au sens de la Loi cantonal sur les transports publics, est chargée de traiter les différents enjeux en lien avec la mobilité à l'échelle régionale. Ses activités se concentrent principalement sur le suivi et l'amélioration de l'offre de transports publics (lignes existantes et nouvelles lignes à l'essai) afin d'en garantir la qualité en termes de cadence (horaires), de desserte (couverture du territoire et correspondances), de rapidité, d'efficacité et de coûts, en lien avec les enjeux de zonage et de tarifs de la Communauté tarifaire Onde Verte. Elle assure également la promotion de la mobilité douce et durable (vélos en libre service, subventions pour les abonnement transports publics, actions de promotion & communication, transports publics nocturnes,…).
Cette commission assure également la coordination avec la stratégie cantonale de mobilité et le Projet d'agglomération RUN (PA), ce qui implique la mise en œuvre des mesures des PA1, PA2 et PA3 ainsi que l'élaboration du PA4 . Enfin, cette commission entretient un lien permanent avec la Conférence des directeurs communaux Mobilité & Transports de l'ACN (lien vers les conférences des directeurs communaux).