La stratégie RUN se fonde notamment sur la mise en réseau des trois villes (Neuchâtel, La Chaux-de-Fonds et Le Locle) et de leur couronne urbaine respective pour former une seule et unique agglomération devant répondre aux défis d'attractivité et de fonctionnement de notre canton pour les prochaines décennies. Celle-ci intègre une alliance entre les espaces urbains et les territoires régionaux, ces derniers ayant pour vocation d'œuvrer au développement et à la valorisation de leurs atouts spécifiques, avec le soutien des villes. Dans ce but, les communes acceptent (pour celles qui ne le sont pas déjà) de se fédérer en associations régionales. En contrepartie, ces dernières deviennent des interlocutrices du Conseil d'Etat. Des contrats politiques naissent de cette nouvelle forme de collaboration verticale; ils sont signés entre l'Etat et chaque région RUN. Ils fixent les objectifs de développement régional et un plan de mise en œuvre.
